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Illumina/Solexa Genome Analyzer平台及罗氏诊断公司推出Genome Sequencer FLX System (GS FLX)平台作为第二代基因组测序系统,在技术上大有取代传统生物芯片的趋势。目前主要有三种应用:一是ChIP-seq是ChIP-chip的升级版,其精确度和敏感度高。二是RNA-Seq,该技术会在一两年内取代expression microarray作为标准的测量基因表达的技术。还有一个是SNP discovery,我们认为也会很快取代genotyping array成为标准的SNP检测技术。
由于Solexa/454平台产生海量的数据,对后续的生物信息学分析提出了更高的要求,针对这一趋势,本公司利用R语言平台及Matlab平台,开发了一套针对大规模测序平台的数据分析系统,现在可以为客户提供如下分析高级分析服务:
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